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需要使用 subprocess 模塊在 python 腳本中運行 AWK 命令

需要使用 subprocess 模塊在 python 腳本中運行 AWK 命令

GCT1015 2023-12-09 15:36:00
c1 = "'BEGIN{FS = OFS = \",\"}{if(toupper($11) ~ \"DVT\"){$(NF+1) = NR==1 ? \"indication\" : \"DVT\"}else if(toupper($11) ~ \"AFIB\"){$(NF+1) = NR==1 ? \"indication\" : \"AFIB\"}else{$(NF+1) = NR==1 ? \"indication\" : \"TESTING\"}} 1'"print(c1)p1=subprocess.Popen(["awk",c1,"abc.csv"],stdout=outfile)p1.communicate()該命令在 shell 腳本中運行良好。所以,命令參數看起來不錯。但是在運行 python 時,我不斷收到錯誤:“表達式中的字符'''無效?!?
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1 回答

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守候你守候我

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外部引號是不必要的。當您有 shell 時,需要使用單引號來保護 Awk 腳本免受 shell 的影響;但在這里,你沒有外殼。然后你可以而且也應該去掉所有這些反斜杠。


如果您只需要運行子進程,然后在完成后繼續您的程序,那么您應該更喜歡subprocess.run()裸露。Popen


c1 = '''BEGIN{FS = OFS = ","}

{if(toupper($11) ~ "DVT"){$(NF+1) = NR==1 ? "indication" : "DVT"}

 else if(toupper($11) ~ "AFIB"){$(NF+1) = NR==1 ? "indication" : "AFIB"}

 else{$(NF+1) = NR==1 ? "indication" : "TESTING"}} 

1'''


print(c1)


result = subprocess.run(["awk", c1, "abc.csv"],

    stdout=outfile)

然而,將 Awk 作為 Python 的子進程運行幾乎總是不必要的。您應該能夠將其重構為大致相同數量的 Python 代碼。


with open("abc.csv") as infile:

    firstline = True

    for line in infile:

        fields = line.rstrip("\n").split(",")

        if firstline:

            added = "indication"

        else:

            ind = fields[10].upper()

            if "DVT" in ind:

                added = "DVT"

            elif "AFIB" in ind:

                added = "AFIB"

            else:

                added = "TESTING"

        fields.append(added)

        outfile.write(",".join(fields) + "\n")

        firstline = False

這有點冗長,但這主要是因為我使用了更具描述性的變量名稱。如果您的輸入文件確實是一個 CSV 文件,csvPython 標準庫中的模塊可以方便地替換分割邏輯等,盡管它隨后引入了自己的一些其他特性。如果您必須處理 CSV 中的引號逗號等,那么這就是它真正增加價值的地方。


總而言之,Awk更簡潔,但那是因為它更專業。將其嵌入到 Python 代碼中的主要缺點是讀者必須了解兩種語言才能理解代碼(盡管避免外部過程也總是好的)。我冒昧地猜測,您收到了這段 Awk 代碼,但沒有任何解釋它是如何工作的,或者如果它損壞了如何修復它......?


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反對 回復 2023-12-09
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