.dicom我正在嘗試使用pydicom和可視化一組文件ipyvolume。我過去常常pydicom讀取文件，然后按位置對它們進行排序，然后將切片變成 3D 數組。我可以繪制數據的 3D 模型，ipyvolume.pylab.plot_isosurface()盡管我不確定這是否是可視化醫學圖像的正確方法（它都是具有相同不透明度和顏色的實體像素）。我也嘗試過ipyvolume.pylab.volshow()，但沒有用。有沒有正確的方法來可視化醫學圖像ipyvolume？或者這不是合適的圖書館？
2 回答
瀟湘沐
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DICOM 文件沒有“體素”數據，因此您不能簡單地在 3D 視圖中繪制 dicom。您應該使用 dicom 系列的切片來估計體素數據。之后，使用諸如 Marching Cubes 之類的 3D 建模算法，您可以提取最終的 3D 模型。
PIPIONE
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我沒有使用 ipyvolume，但查看文檔它應該能夠可視化 DICOM 圖像集。
如果您想嘗試其他包，我使用 SimpleITK 加載 DICOM 圖像，并使用 itkwidgets 在 Jupyter 筆記本中進行體積可視化。
這是一個加載 DICOM 系列并顯示它的簡單筆記本：
import SimpleITK as sitk
import itkwidgets
# Get the DICOM file names in the current directory
names = sitk.ImageSeriesReader.GetGDCMSeriesFileNames('.')
# Read the DICOM series
reader = sitk.ImageSeriesReader()
reader.SetFileNames(names)
img = reader.Execute()
itkwidgets.view(img)
如果目錄中有多個 DICOM 系列，GetGDCMSeriesFileNames 有一個 seriesID 參數，您可以給它指定要加載的系列。
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