我的原始圖像是 DICOM 格式，我想以無損 jpg 格式保存它（或至少保留盡可能多的信息！?。。?。我怎么能在python中做到這一點？目前，我正在使用以下代碼生成有損 png 圖像。我稱之為有損 png，因為當我通過 dicom 瀏覽器看到 dicom 圖像時，png 圖像看起來與 dicom 圖像不同。另外，如何修改此圖像以獲取 jpg 圖像而不是 png 圖像。import numpy as npimport pngimport pydicomds = pydicom.dcmread("./MyImage.dcm")shape = ds.pixel_array.shape# Convert to float to avoid overflow or underflow losses.image_2d = ds.pixel_array.astype(float)# Rescaling grey scale between 0-255image_2d_scaled = (np.maximum(image_2d,0) / image_2d.max()) * 256# Convert to uintimage_2d_scaled = np.uint8(image_2d_scaled)# Write the PNG filewith open("out.png", 'wb') as png_file: w = png.Writer(shape[1], shape[0], greyscale=True) w.write(png_file, image_2d_scaled)
2 回答
MM們
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還有另一種使用 OpenCV 和 pydicom 庫將 Dicom 圖像轉換為 JPEG 或 PNG 格式的有效方法。下面的代碼在一次運行中將所有 dicom 圖像集轉換為 jpeg/png（使用 for 循環）。
import pydicom as dicom
import os
import cv2
# make it True if you want in PNG format
PNG = False
# Specify the .dcm folder path
folder_path = "/Image"
# Specify the output .jpg/png folder path
jpg_folder_path = "/JPGImage"
images_path = os.listdir(folder_path)
for n, image in enumerate(sorted(images_path)):
print(os.path.join(folder_path, image))
ds = dicom.dcmread(os.path.join(folder_path, image), force=True)
ds.file_meta.TransferSyntaxUID = dicom.uid.ImplicitVRLittleEndian
pixel_array_numpy = ds.pixel_array
if PNG == False:
image = image.replace('.dcm', '.jpg')
else:
image = image.replace('.dcm', '.png')
pixel_array_numpy2 = cv2.flip(pixel_array_numpy, 0)
cv2.imwrite(os.path.join(jpg_folder_path, image), pixel_array_numpy2)
慕神8447489
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丟失信息的問題取決于像素深度，而不是圖像壓縮。您的 DICOM 圖像可能每像素大約 11 位（從 -1024 到 1023），甚至可能更多。您無需設置強度窗口即可將其轉換為 8 位圖像。
這意味著值 -1024 的原始像素變為黑色，+1023 的像素變為白色，但圖像最重要的部分，從 -100 到 +300 左右變為平均灰色。如果你對肺感興趣，那么重要的值就低，如果你想看到骨頭，那么它們就更高等等。最重要的是，你不能在單個 png/jpg/bmp 圖像上看到 DICOM 圖像的所有部分。您需要一個特殊的查看器，它允許設置灰度級?？梢蕴幚砣袼厣疃鹊淖畛Ｒ姷姆轻t學格式是 TIFF，但您仍然需要一個特殊的查看器。
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