無痛的方式來安裝新版本的R？有沒有人有一個很好的技巧來進行升級，從安裝軟件到復制所有設置/包？這個建議包含在評論中，是我最近一直在使用的。首先安裝新版本，然后在舊版本中運行：#--run in the old version of Rsetwd("C:/Temp/")packages <- installed.packages()[,"Package"]save(packages, file="Rpackages")在新版本中遵循以下內容：#--run in the new versionsetwd("C:/Temp/")load("Rpackages")for (p in setdiff(packages, installed.packages()[,"Package"]))install.packages(p)
3 回答
慕沐林林
TA貢獻2016條經驗 獲得超9個贊
為了完整起見，有一些方法可以防止您遇到此問題。正如Dirk所說，將包保存在計算機上的另一個目錄中。
install.packages("thepackage",lib="/path/to/directory/with/libraries")您可以更改默認.Library使用的函數值.libPaths太
.libPaths("/path/to/directory/with/libraries")這會將此路徑作為.Library變量中的第一個值，并使其成為默認值。
如果要進一步自動化，可以在Rprofile.site文件中指定它，您可以在R build的/ etc /目錄中找到它。然后每次加載時它都會自動加載，你不必再擔心了。您只需從指定目錄安裝和加載包即可。
最后，我的Rprofile.site中包含一些小代碼，允許我在安裝新R版本時重新安裝所有軟件包。您只需在更新到新R版本之前列出它們。我使用包含所有包的更新列表的.RData文件。
library(utils)## Check necessary packagesload("G:\Setinfo\R\packagelist.RData") # includes a vector "pkgs"installed <- pkgs %in% installed.packages()[, 'Package']if (length(pkgs[!installed]) >=1){
install.packages(pkgs[!installed])}我通過.Last()在我的Rprofile.site中指定來創建packagelist.RData 。如果我安裝了一些，則更新包列表：
.Last <- function(){
pkgs <- installed.packages()[,1]
if (length(pkgs) > length(installed)){
save(pkgs,file="G:\Setinfo\R\packagelist.RData")
}}當我安裝新的R版本時，我只需將必要的元素添加到Rprofile.site文件中，然后重新安裝所有軟件包。無論如何我必須調整Rprofile.site（使用和比，為Tinn-R添加額外的代碼，這些東西），所以這不是真正的額外工作。它只需要額外的時間來重新安裝所有包。
最后一位相當于原始問題中給出的解決方案。我不需要擔心首先獲得“已安裝”列表。
同樣，如果您的軟件包未從CRAN安裝，則無法完美運行。但是這個代碼很容易擴展，包括那些代碼。
慕田峪7331174
TA貢獻1828條經驗 獲得超13個贊
如果你有先見之明，接受的答案可能會有效，但我已經擺脫了舊版本，因此無法遵循這些指示。下面描述的步驟適用于從2.1和3.1升級的OSX。
更新：要獲取最新版本的目錄（而不是鍵入3.1或3.2），您可以使用以下命令。第二個直接轉換為R變量，跳過.和，..并.DS_Store使用：
OLD=$(ls -d /Library/Frameworks/R.framework/Versions/*.* |tail -n 2 | head -n 1)Resources/library/echo "packages = c(\"`ls $OLD | tail +4| paste -s -d ',' - | sed -E 's|,|\",\"|'g`\")" | tr -d "/"
（添加|pbcopy到最后將其直接復制到Mac剪貼板）
然后在R中，您可以粘貼生成的變量。一旦在新版本的R中定義了它，您就可以按照上面的說明遍歷已安裝的軟件包......
for (p in setdiff(packages, installed.packages()[,"Package"])) install.packages(p, dependencies=TRUE, quiet=TRUE, ask=FALSE)
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