一、 安裝RODBC庫

1、進入R語言的GUI界面（RGUI.EXE)，在菜單欄選擇“程序包/安裝程序包

2、在彈出的窗口里往下拉，選擇RODBC如圖，點擊確定

3、在ODBC數據源管理器里將需要的數據庫添加進去，這里筆者使用的是SQL Server2008，驅動程序選擇Native Client10.0

3、在R語言窗口輸入連接語句
> library(RODBC)
**這里是載入RODBC庫
> channel<-odbcConnect("MyTest",uid="ripley",case="tolower")
**連接剛才添加進數據源的“MyTest”數據庫
**ch <- odbcConnect("some dsn ", uid = "user ", pwd = "**** ")
**表示用戶名為user，密碼是****，如果沒有設置，可以直接忽略
> data(USArrests)
**將“USArrests”表寫進數據庫里（這個表是R自帶的）
> sqlSave(channel,USArrests,rownames = "state",addPK = TRUE)
**將數據流保存，這時候打開SQL Server就可以看到新建的USArrests表了
> rm(USArrests)
> sqlTables(channel)
**給出數據庫中的表
> sqlFetch(channel,"USArrests",rownames = "state")
**輸出USArrests表中的內容
> sqlQuery(channel,"select * from USArrests")
**調用SELECT查詢語句并返回結果（如圖）

> sqlDrop(channel,"USArrests")
**刪除表
> odbcClose(channel)
**最后要記得關閉連接
當然，通過這個辦法也可以讀取Excel、Access表中的內容，具體方法類似，這里不再重復

有現成的包：matchprobes包 里面有個函數basecontent(seq)計算4中堿基每種的含量；
自己做的話：
#List是你的序列
unlist(strsplit(List,""))->sep.letter;#把每個字母都單獨分開
#遍歷所有字母
count_a=0; count_g=0; count_t=0; count_c=0;
for(i in 1:length(sep.letter)){
if(sep.letter[i]=="a"){count_a=count_a+1;}
if(sep.letter[i]=="g"){count_g=count_g+1;}
.........................
}

另一種是DBI方式，所以個人比較偏好用DBI連接方式。有下面這幾種主要的包提供了DBI連接，可以根據已經安裝的數據庫類型來安裝相應的驅動。因為后者保留了各數據庫原本的特性，根據連接方式不同我們有兩種選擇：一種是ODBC方式，需要安裝RODBC包并安裝ODBC驅動當然也可以將R與外部數據庫連接，直接在R中操作數據庫，這也是一種可行的方法。在R中連接數據庫需要安裝其它的擴展包，并生成最終結果。

當然也可以將R與外部數據庫連接，直接在R中操作數據庫，并生成最終結果，這也是一種可行的方法。在R中連接數據庫需要安裝其它的擴展包，根據連接方式不同我們有兩種選擇：一種是ODBC方式，需要安裝RODBC包并安裝ODBC驅動。另一種是DBI方式，可以根據已經安裝的數據庫類型來安裝相應的驅動。因為后者保留了各數據庫原本的特性，所以個人比較偏好用DBI連接方式。有下面這幾種主要的包提供了DBI連接：RMySQL，RSQLite，ROracle，RPostgreSQL。由名字看得出它們分別對應了幾種主流的數據庫。