R中調試的一般建議我在使用我編寫的R函數時出錯：Warning messages:1: glm.fit: algorithm did not converge
2: glm.fit: algorithm did not converge我所做的：逐步完成功能添加打印以找出錯誤發生在哪一行，這意味著兩個不應該使用的函數glm.fit..他們是window()和save().我的一般方法包括添加print和stop命令，并逐行遍歷函數，直到找到異常為止。但是，我不清楚這些技術是從代碼中產生錯誤的。我甚至不確定代碼中的哪些函數依賴于glm.fit..我該如何診斷這個問題？
3 回答
莫回無
TA貢獻1865條經驗 獲得超7個贊
當發生錯誤時，我通常做的第一件事是通過調用 traceback()：這顯示了錯誤發生的位置，如果您有幾個嵌套函數，這一點尤其有用。 接下來我會 options(error=recover)這會立即切換到出現錯誤的瀏覽器模式，這樣您就可以從那里瀏覽工作區。 如果我仍然沒有足夠的信息，我通常使用 debug()函數并逐行遍歷腳本。
findLineNum()setBreakpoint()
try()tryCatch()
MYYA
TA貢獻1868條經驗 獲得超4個贊
Rprof()summaryRprof()profr
集 options(warn=2)將警告視為錯誤
options
集 options(error=recover)跑 recover()當發生錯誤時，正如Shane所指出的(如 ..或者任何其他你認為有用的函數都可以運行。
將內部函數調用包裝為 try()若要返回更多信息，請執行以下操作。 對于*應用函數，使用 .inform=TRUE(來自plyr包)作為Apply命令的選項
browser()
放入您可能要調試的函數中。 browser(expr=isTRUE(getOption("myDebug")))并將全局選項設置為 options(myDebug=TRUE)您甚至可以包裝瀏覽器調用： myBrowse <- browser(expr=isTRUE(getOption("myDebug")))然后打電話給 myBrowse()因為它使用了全局。
findLineNum()獲取源文件名和行號，并返回函數和環境。當你 source()一個.R文件，它在#n行返回一個錯誤，但是您需要知道#n行中的函數是什么。 setBreakpoint()獲取源文件名和行號，并在其中設置斷點。
checkUsage
setBreakpoint()trace()
fixInNamespaceassignInNamespace
options(error=dump.frames)
- 3 回答
- 0 關注
- 964 瀏覽
添加回答
舉報
0/150
提交
取消