應該是環境變量沒有全部配正確吧，重新配一下試試
1、首先安裝好jdk 配置好環境變量 jdk安裝時最好路徑不要有空格
配置環境變量【可以配置成系統變量多個時中間;號隔開】：
JAVA_HOME=C:\Program Files\Java\jdk1.5.0_06【java最后的安裝目錄】(不要封號)
PATH=C:\Program Files\Java\jdk1.5.0_06\bin;【java最后的安裝目錄下bin目錄】
classpath=.;D:\J2EE\jdk1.6\lib\dt.jar;D:\J2EE\jdk1.6\lib\tools.jar;【三項】
最后在控制臺看javac java -version命令結果就知道成功沒
【可以直接拷貝過去一個免安裝版（別的地方已經安裝過的包直接用） C:\Program Files\Java\jdk1.5.0_06 不需要配置環境變量 如果只是在myeclpse中用 他會幫你找到】
2、tomcat
【可以直接拷貝過去一個免安裝版（別的地方已經安裝過的包直接用） C:\jakarta-tomcat-5.0.28\jakarta-tomcat-5.0.28】
安裝配置環境變量：
CLASSPATH=C:\jakarta-tomcat-5.0.28\jakarta-tomcat-5.0.28\common\lib\servlet.jar;C:\jakarta-tomcat-5.0.28\jakarta-tomcat-5.0.28\common\lib\servlet-api.jar;
CATALINA_HOME=C:\jakarta-tomcat-5.0.28\jakarta-tomcat-5.0.28[安裝目錄]
測試 通過http://localhost:8080看結果【這里端口號就看你在server里怎么設置了】

安裝了jdk設置好環境變量，不能運行jar文件的原因和解決方式如下：

1:配置環境變量
a：計算機——右鍵——屬性——高級系統設置——高級——環境變量
b：系統變量——新建——變量名：JAVA_HOME
變量值：D:\java\jdk——確定
c：系統變量——新建——變量名：CLASSPATH
變量值：.;%JAVA_HOME%\lib;%JAVA_HOME%\lib\dt.jar;%JAVA_HOME%\lib\tools.jar——確定
d：找到Path——編輯——變量值：在最前面加上%JAVA_HOME%\bin;%JAVA_HOME%\jre\bin;——確定
2:修改注冊表
開始——regedit.exe——是——HKEY_CLASSES_ROOT\Applications\javaw.exe\shell\open\command——默認（左擊）——右鍵（修改）——"D:\java\jre\bin\javaw.exe" -jar "%1" %*
3：修改注冊表
HKEY_CLASSES_ROOT\jar_auto_file\shell\open\command——默認（左擊）——右鍵（修改）——"D:\java\jre\bin\javaw.exe" -jar "%1" %*
注意：2和3的路徑必須一致，"D:\java\jre\bin\javaw.exe"為自己JDK中javaw.exe的路徑
4：找到jar文件——右鍵——打開方式——選擇默認程序——瀏覽——計算機——D:\java\jre\bin\javaw.exe——一路確定下去——OK
5：雙擊運行*.jar，發現可以運行。

估計是你打的jar包有問題，
運行jar的語法是
java -jar jar文件路徑(如:C:\xxx.jar)