寸有所短，尺有所長。各個語言都有各自的特色和不足，不可以好/壞來評價。應該以自己需求來選擇最合適的編程語言。
1、 效率方面：C++注重運行效率，如果對實時性有較高要求，首選C++/C語言。C#寫成的代碼,都是先被編譯成中間語言（IL，Intermediate Language，在運行時，再由即時編譯器（JIT，Just-In-Time）編譯成本機代碼，所以實時性上少欠一籌。
2、依賴性：C++可以生成native（本地代碼），不用依賴于.net framework；C#需要相應版本的.net framework支持。
3、可移植性：采用標準C++編寫的代碼（或使用QT編寫的代碼）可移植性還是比較強的；采用C#編寫的程序目前基本上只能運行于windows系統上，linux平臺上有個mono項目用于將C#遷移到linux平臺使用，但是目前該項目還有很長的路要走。
4、易用性：C++從C語言過渡而來，對C語言保持了最大的兼容性，熟悉C語言的用戶很容易上手，但是也因為這一原因，使C++不是一個純粹的面向對象的語言。而C#則是一個徹底的面向對象語言。C++中最特色的部分就是指針，但是現在普遍認為應該適度使用指針，因為它太容易出問題了，C++中可以設置全局變量；C#很少使用指針（還存在，在非安全代碼中仍使用），沒有全局變量。C++中程序員要自行處理對象的析構，容易出錯；C#有垃圾回收機制（從java借鑒過來的，其實還有很多東西都像是從java學來的），程序員不用再過分擔憂對象的析構了，一切交給系統來處理。初學者C#更容易上手。
5、數據庫：大多數數據庫軟件都為二者提供了相應的訪問接口，相對而言C#更容易使用。
6、網頁編程：很明顯，C#在Web編程上更現代，更靈活，更易用。
7、并行編程：例如nVidia的CUDA并行計算架構只對C++提供了支持，盡管有第三方提供了面向C#的接口，還是使用C++更方便一些。