為什么用MLR估計和bootstrap結果不一樣，同樣的數據！
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臨摹微笑
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很正常的，特別是當一些分枝之間的遺傳距離很相近，沒辦法確定分枝之間的進化關系。我不知道你清不清楚bootstrap的算法。如果你用的是序列的話，簡單的講就是把序列的位點都重排，重排后的序列再用相同的辦法構樹
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