沒有主鍵的概念(因為對象的內存地址,或者引用就能標志一個對象了).因而外界想指向一個具體的對象就比較困難(比如本頁的url里的1079505).

激活/保存層次的問題.獲取一個對象,它的字段引用了其它對象,那么到底激活多少層次合適?保存時也是如此.層次深了傷性能,層次淺了用著不方便(動不動就是Null reference).

對象引用問題.RDBMS里我們能很輕易地明白一個引用指向的是對象的淺拷貝(因為只引用了一個主鍵).而一旦與內存中的對象勾搭起來,那深拷貝和淺拷貝就不容易區分了,很難說清我刪除了一個對象會不會讓某個其它對象的某個字段變成null(同樣,修改對象也不容易看清其影響范圍).

對象生存期問題.這是個看起來很奇怪甚至愚蠢的問題:沒有被其它對象引用的對象是否應該存在于數據庫中?換句話說,ODBMS要不要擁有GC功能?如果有GC功能的話,能夠避免誤刪除被其它對象引用的對象,而且能夠清除不再需要的數據.但是相應地,它讓開發必須考慮更多的問題,保證每個對象的靜態可達性.

數據庫版本進化難以跟蹤.由于數據庫的結構與對象的結構基本一致,對對象模型的任何修改都會導致數據庫結構的變化,而這個過程中原有數據如何處理必須加以特殊處理(Db4O里提供了字段改名之類的api,但是至少我很討厭每修改一次對象就要寫幾行這樣的代碼).換句話說,我覺得數據庫和對象之間耦合嚴重了,不利于修改.

沒有類似Sql的成熟且流行的查詢語言(或者你必須學習一種新語言)進行數據管理.很多時候,直接操作數據庫也是必須的,這時你會非常想念Sql.